4. сбор за участие в конкурсе (аукционе) (вносится всеми участниками и является одним из условий регистрации заявки; сумма сбора определяется исходя из стоимости затрат на подготовку, проведение и подведение итогов конкурса (аукциона), оплату труда привлекаемых экспертов и подлежит зачислению на счета федерального органа управления государственным фондом недр (МПР России) либо его территориальных органов);

5. сбор за выдачу лицензий (вносится пользователями недр при выдаче лицензии; размер сбора и порядок его взимания определяются МПР России по согласованию с Минфином России исходя из расходов на экспертизу заявок на получение лицензий, организацию конкурсов и аукционов, оплату пакетов геологической информации и иных расходов, связанных с предоставлением лицензий).

Помимо вышеперечисленных платежей пользователи недр могут привлекаться к возмещению ущерба, нанесенного безлицензионным пользованием недрами, в результате выборочной отработки богатых участков месторождений полезных ископаемых, а также иных действиях, которые привели к порче месторождения или созданию условий, частично или полностью исключающих возможность дальнейшего пользования недрами. Возмещение вреда, причиненного государству, производится путем взносов в федеральный бюджет, бюджеты субъектов Российской Федерации и местные бюджеты. Однако денежная форма может быть заменена проведением работ по восстановлению нарушенных естественных свойств недр по соглашению заинтересованных сторон.